Un sistema di fossa biologica è come un impianto di trattamento delle acque reflue su piccola scala che gestisce i rifiuti domestici solidi e liquidi scaricati nel water e nel bagno. I batteri svolgono l'importantissima funzione di degradare i rifiuti solidi organici nella fossa. Pertanto, il giusto equilibrio di batteri sani è essenziale per la massima efficienza del sistema.